Bij het schoonmaken van een nieuw aquarium op school ontdekt Sabrina nogal ongewone onderwaterbewoners. Ze verandert zichzelf in een zeemeerminnetje en ontdekt de verloren stad van Atlantis... in het aquarium! Deze grootse gekrompen stad is de woonplaats van een volk zo oud dat ze zelf niet meer weten hoe ze ook alweer zijn ontstaan. Maar de Atlantisbewoners kunnen niet vermoeden dat Sabrina een van de legendarische Schelpenkoninginnen is die de stad terug zal brengen naar de Eindeloze Wateren. Sabrina wil de stad zijn rechtmatige plek op aarde teruggeven, maar hoe kan ze dat doen zonder haar toverkrachten te tonen aan meneer Kraft, de conrector, en haar sterfelijke klasgenoten? En wat als iemand helemaal niet wil dat de verloren stad gevonden wordt?