Geboren te Gent, Oost-Vlaanderen. Jean Paul Van Bendegem is een Belgische wiskundige, filosoof, auteur en emeritus hoogleraar logica en wetenschapsfilosofie aan de Vrije Universiteit Brussel.
In 1976 behaalde hij aan de Rijksuniversiteit Gent een licentiaat in de wiskunde met een verhandeling over Tijdsafhankelijke Verzamelingenleer. In 1979 behaalde hij er ook een licentie wijsbegeerte met een verhandeling over catastrofetheorie. Hij doctoreerde in 1983 aan de Gentse universiteit met een verhandeling over eindige, empirische wiskunde.
Zijn onderzoek gaat in de eerste plaats naar de “Grondslagen en filosofie van Wiskunde en Logica”. Meer bepaald verdedigt hij een vorm van strikt finitisme, een strikt eindige opvatting van de wiskunde, waarin geen plaats is voor het oneindige. Door verder te gaan op deze problematiek is hij via de wiskunde en de natuurwetenschappen uiteindelijk bij de religie terechtgekomen. Dit gaf aanleiding tot de publicatie van het boek Tot in der eindigheid, waarin een reeks argumenten - van godsbewijzen tot antropische principes - wordt geanalyseerd met de steeds terugkomende conclusie dat er niets dwingends valt vast te stellen.
Op vlak van levensbeschouwing noemt hij zichzelf, in navolging van wijlen Leo Apostel, "een spiritueel atheïst". Hij is ook een vooraanstaand lid van de Belgische Vrijmetselaarsloge. Hij bekleedt het hoofdredacteurschap van het kwartaaltijdschrift Logique et Analyse en is promotor van diverse doctorale projecten aan het Centrum voor Logica en Wetenschapsfilosofie, waar hij tevens directeur is. Hij is stichtend lid en ere-voorzitter van SKEPP. Zijn interesse voor de wereld van het paranormale vloeit naar eigen zeggen voort uit zijn belangstelling voor de wetenschapsfilosofie.
In zijn vrije tijd verzorgt hij columns in het weekblad Knack. In oktober 2007 nam hij deel aan het populaire VRT-programma De Slimste Mens ter Wereld. Zijn boek Over wat ik nog wil schrijven behandelt 11 verschillende thema's: film, literatuur, strips, wiskunde, vrijmetselarij, muziek, architectuur, erotiek, porno, religie en Sherlock Holmes. In het achtste seizoen van het satirische programma De Ideale Wereld zetelde Van Bendegem als sidekick van Otto-Jan Ham. In het TV-programma Iedereen Beroemd had hij samen met Ignaas Devisch een wekelijkse rubriek Doordenkers waarin zij een filosofisch antwoord gaven op alledaagse vragen. In 2014 ontving van Bendegem een prijs van de Vrije Universiteit Brussel voor zijn pogingen om filosofie in contact te brengen met de maatschappij.
Hij geeft vaak lezingen over uiteenlopende thema's. Wiskunde, logica, atheïsme, filosofie, Sherlock Holmes (samen met Vitalski en Johan Braeckman) en humor zijn enkele van de onderwerpen. Van Bendegem is een groot kenner en bewonderaar van het werk van Wittgenstein. In 2019 verzorgde hij bij het Centre Erasme voor het eerst een winterschool over de Tractatus van Wittgenstein. In 2020 kwam een vervolg met een cursus over de Filosofische Onderzoekingen.