Geboren te Ginneken. Was een Nederlands egyptoloog. Borghouts was een zoon van theoretisch fysicus Abraham Nicolaas Borghouts (1910-1989) en W.D.C. van den Bosch. Hij promoveerde in 1971 te Leiden op 'The magical texts of Papyrus Leiden I 348'. Vanaf 1976 was hij werkzaam als wetenschappelijk medewerker egyptologie aan de Rijksuniversiteit Leiden. Per 1 januari 1986 werd hij aangesteld als gewoon hoogleraar egyptologie; hij hield zijn oratie op 2 december 1986 onder de titel Nieuwjaar in het oude Egypte. Per 1 juli 2004 ging hij met emeritaat; zijn opvolger was prof. dr. Olaf Kaper (1962). Ook na zijn emeritaat bleef hij werkzaam bij het in Leiden gevestigde Nederlands Instituut voor het Nabije Oosten, en begeleidde hij nog promovendi. Borghouts kreeg bekendheid door zijn 'Egyptische sagen en verhalen' dat voor het eerst verscheen in 1974 en waarvan nog in 1988 een negende druk verscheen. Sinds 1999 was Borghouts lid van de Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen. Overleden te Leiden
