Wayward Pines telt 461 inwoners. Idyllisch gelegen in een vallei en omgeven door schilderachtige bergpartijen waan je je in een modern paradijs... ware het niet dat het dorp wordt omgeven met een onder stroom staand hek met daarop prikkeldraad en het ook nog eens vierentwintig uur per dag door scherpschutters in de gaten gehouden. Elk van de 461 inwoners werd wakker na een afschuwelijk ongeluk. In elk huis en bedrijfsgebouw hangen verborgen camera's
De inwoners weten geen van allen hoe ze er terecht zijn gekomen. Hun wordt verteld waar ze komen te wonen. Waar ze komen te werken. Met wie ze moeten trouwen. Sommigen denken dat ze dood zijn en zich in het hiernamaals bevinden. Anderen denken dat ze in een experimentele gevangenis zitten. En iedereen droomt er stiekem van om te vluchten, maar de weinigen die het proberen komen voor een angstaanjagende verrassing te staan.
Ethan Burke heeft de wereld achter de afscherming gezien. Hij is de sheriff en de enige die de waarheid kent - Wayward Pines is niet zomaar een dorp. En wat er zich aan de andere kant bevindt is een nachtmerrie die ieders voorstelling te boven gaat.